MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Crinalium epipsammum PCC 9333 plasmid pCRI9333.07

Total Repeats: 497

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019737	GAT	2	6	782	787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303660
2	NC_019737	T	6	6	916	921	0 %	100 %	0 %	0 %	428303660
3	NC_019737	AAC	2	6	938	943	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428303660
4	NC_019737	CAA	2	6	953	958	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428303660
5	NC_019737	ACAA	2	8	1014	1021	75 %	0 %	0 %	25 %	428303660
6	NC_019737	GGC	2	6	1069	1074	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428303660
7	NC_019737	TAC	2	6	1168	1173	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303660
8	NC_019737	CAC	2	6	1222	1227	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428303660
9	NC_019737	ATC	2	6	1297	1302	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303660
10	NC_019737	TTAGAT	2	12	1319	1330	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	428303660
11	NC_019737	GAAG	2	8	1372	1379	50 %	0 %	50 %	0 %	428303660
12	NC_019737	TTA	2	6	1464	1469	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428303660
13	NC_019737	ACT	2	6	1505	1510	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303660
14	NC_019737	CAG	2	6	1599	1604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428303660
15	NC_019737	GCG	2	6	1630	1635	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428303660
16	NC_019737	TGA	2	6	1674	1679	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303660
17	NC_019737	TCA	2	6	1702	1707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303660
18	NC_019737	TTA	2	6	1724	1729	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428303660
19	NC_019737	TTTAG	2	10	1735	1744	20 %	60 %	20 %	0 %	428303660
20	NC_019737	ACTT	2	8	1797	1804	25 %	50 %	0 %	25 %	428303661
21	NC_019737	ATT	2	6	1829	1834	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428303661
22	NC_019737	ACG	2	6	1849	1854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428303661
23	NC_019737	ATC	2	6	1871	1876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303661
24	NC_019737	TGA	2	6	1881	1886	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303661
25	NC_019737	TAATT	2	10	1899	1908	40 %	60 %	0 %	0 %	428303661
26	NC_019737	GAA	2	6	1909	1914	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428303661
27	NC_019737	CGA	2	6	1939	1944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428303661
28	NC_019737	TGA	2	6	2037	2042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303661
29	NC_019737	TGC	2	6	2142	2147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428303661
30	NC_019737	CTAT	2	8	2161	2168	25 %	50 %	0 %	25 %	428303661
31	NC_019737	TTG	2	6	2959	2964	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428303662
32	NC_019737	TCTTGT	2	12	3017	3028	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	428303662
33	NC_019737	ATTCC	2	10	3038	3047	20 %	40 %	0 %	40 %	428303662
34	NC_019737	TTCG	2	8	3100	3107	0 %	50 %	25 %	25 %	428303662
35	NC_019737	TAC	2	6	3142	3147	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303662
36	NC_019737	T	6	6	3152	3157	0 %	100 %	0 %	0 %	428303662
37	NC_019737	GTT	2	6	3186	3191	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428303662
38	NC_019737	TAA	2	6	3282	3287	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428303662
39	NC_019737	TTA	2	6	3293	3298	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428303662
40	NC_019737	CTTC	2	8	3351	3358	0 %	50 %	0 %	50 %	428303662
41	NC_019737	CA	3	6	3422	3427	50 %	0 %	0 %	50 %	428303662
42	NC_019737	ATT	2	6	3478	3483	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428303662
43	NC_019737	ATCC	2	8	3491	3498	25 %	25 %	0 %	50 %	428303662
44	NC_019737	TTC	2	6	3499	3504	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428303662
45	NC_019737	AGC	2	6	3534	3539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428303662
46	NC_019737	TTCTC	2	10	3575	3584	0 %	60 %	0 %	40 %	428303662
47	NC_019737	TCA	4	12	3605	3616	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303662
48	NC_019737	ATC	3	9	3622	3630	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303662
49	NC_019737	CAT	2	6	3771	3776	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303662
50	NC_019737	CTT	2	6	3798	3803	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428303662
51	NC_019737	TTG	2	6	3817	3822	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428303662
52	NC_019737	TGG	2	6	3856	3861	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428303662
53	NC_019737	CTT	2	6	3906	3911	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428303662
54	NC_019737	CTA	2	6	3948	3953	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303662
55	NC_019737	AT	3	6	3992	3997	50 %	50 %	0 %	0 %	428303662
56	NC_019737	T	7	7	4047	4053	0 %	100 %	0 %	0 %	428303662
57	NC_019737	TTC	2	6	4057	4062	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428303662
58	NC_019737	T	7	7	4130	4136	0 %	100 %	0 %	0 %	428303662
59	NC_019737	ATC	2	6	4159	4164	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303662
60	NC_019737	CTG	2	6	4191	4196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428303662
61	NC_019737	TCT	2	6	4202	4207	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428303662
62	NC_019737	TTC	2	6	4267	4272	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428303662
63	NC_019737	GA	3	6	4281	4286	50 %	0 %	50 %	0 %	428303662
64	NC_019737	TTG	2	6	4308	4313	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428303662
65	NC_019737	TTG	2	6	4338	4343	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428303662
66	NC_019737	TGT	2	6	4347	4352	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428303662
67	NC_019737	TTC	2	6	4353	4358	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428303662
68	NC_019737	TGAT	2	8	4375	4382	25 %	50 %	25 %	0 %	428303662
69	NC_019737	TGC	3	9	4474	4482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428303662
70	NC_019737	ATT	2	6	4740	4745	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428303663
71	NC_019737	CT	3	6	4754	4759	0 %	50 %	0 %	50 %	428303663
72	NC_019737	AGA	2	6	4813	4818	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428303663
73	NC_019737	TACT	2	8	4913	4920	25 %	50 %	0 %	25 %	428303663
74	NC_019737	CTA	2	6	4928	4933	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303663
75	NC_019737	TCT	2	6	4938	4943	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428303663
76	NC_019737	CTT	2	6	4956	4961	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428303663
77	NC_019737	AAT	2	6	4983	4988	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428303663
78	NC_019737	CTT	2	6	5094	5099	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428303663
79	NC_019737	TG	3	6	5135	5140	0 %	50 %	50 %	0 %	428303663
80	NC_019737	AG	3	6	5176	5181	50 %	0 %	50 %	0 %	428303663
81	NC_019737	GTC	2	6	5182	5187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428303663
82	NC_019737	TTG	2	6	5324	5329	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428303664
83	NC_019737	TC	3	6	5346	5351	0 %	50 %	0 %	50 %	428303664
84	NC_019737	AGT	2	6	5385	5390	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303664
85	NC_019737	CAA	2	6	5403	5408	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428303664
86	NC_019737	CAA	2	6	5517	5522	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428303664
87	NC_019737	GTTG	2	8	5526	5533	0 %	50 %	50 %	0 %	428303664
88	NC_019737	T	7	7	5549	5555	0 %	100 %	0 %	0 %	428303664
89	NC_019737	GA	3	6	5624	5629	50 %	0 %	50 %	0 %	428303664
90	NC_019737	CAA	2	6	5658	5663	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428303664
91	NC_019737	ATT	2	6	5766	5771	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428303664
92	NC_019737	AGA	2	6	5774	5779	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428303664
93	NC_019737	ACCG	2	8	5787	5794	25 %	0 %	25 %	50 %	428303664
94	NC_019737	CAA	2	6	5834	5839	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428303664
95	NC_019737	ACG	2	6	5847	5852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428303664
96	NC_019737	CG	3	6	5880	5885	0 %	0 %	50 %	50 %	428303664
97	NC_019737	CATGC	2	10	5943	5952	20 %	20 %	20 %	40 %	428303664
98	NC_019737	ACT	2	6	6043	6048	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303664
99	NC_019737	A	6	6	6072	6077	100 %	0 %	0 %	0 %	428303664
100	NC_019737	A	6	6	6085	6090	100 %	0 %	0 %	0 %	428303664
101	NC_019737	TTA	2	6	6120	6125	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428303664
102	NC_019737	AT	3	6	6148	6153	50 %	50 %	0 %	0 %	428303664
103	NC_019737	CCA	2	6	6226	6231	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428303664
104	NC_019737	CAA	2	6	6240	6245	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428303664
105	NC_019737	TGC	2	6	6335	6340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428303664
106	NC_019737	TGG	2	6	6354	6359	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428303664
107	NC_019737	AGA	2	6	6368	6373	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428303664
108	NC_019737	T	6	6	6428	6433	0 %	100 %	0 %	0 %	428303664
109	NC_019737	AAAC	2	8	6462	6469	75 %	0 %	0 %	25 %	428303664
110	NC_019737	ATT	2	6	6514	6519	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428303664
111	NC_019737	GAAT	2	8	6563	6570	50 %	25 %	25 %	0 %	428303664
112	NC_019737	TTAT	2	8	6650	6657	25 %	75 %	0 %	0 %	428303664
113	NC_019737	CAT	2	6	6666	6671	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303664
114	NC_019737	TTC	2	6	6686	6691	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428303664
115	NC_019737	CAG	2	6	6754	6759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428303664
116	NC_019737	TCAA	2	8	6772	6779	50 %	25 %	0 %	25 %	428303664
117	NC_019737	ATC	2	6	6852	6857	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303664
118	NC_019737	TACTGT	2	12	7064	7075	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	428303665
119	NC_019737	GTC	2	6	7101	7106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428303665
120	NC_019737	CTG	3	9	7130	7138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428303665
121	NC_019737	CTG	2	6	7172	7177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428303665
122	NC_019737	GTT	2	6	7187	7192	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428303665
123	NC_019737	CTG	4	12	7214	7225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428303665
124	NC_019737	TAT	2	6	7301	7306	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428303665
125	NC_019737	TAAC	2	8	7357	7364	50 %	25 %	0 %	25 %	428303665
126	NC_019737	TTG	2	6	7374	7379	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428303665
127	NC_019737	AGC	2	6	7548	7553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428303665
128	NC_019737	GTTC	2	8	7600	7607	0 %	50 %	25 %	25 %	428303665
129	NC_019737	TAA	2	6	7700	7705	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428303665
130	NC_019737	GAAA	2	8	7718	7725	75 %	0 %	25 %	0 %	428303665
131	NC_019737	TGA	2	6	7804	7809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303665
132	NC_019737	TTA	2	6	7882	7887	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428303665
133	NC_019737	ATC	2	6	7920	7925	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303665
134	NC_019737	ATT	3	9	7968	7976	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428303665
135	NC_019737	GCA	2	6	7996	8001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428303665
136	NC_019737	CTG	2	6	8016	8021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428303665
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139	NC_019737	TAA	2	6	8108	8113	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428303665
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